丞相祠堂也是为纪念诸葛亮而修建的，与大公堂相距百米，坐东朝西，平面按“回”字形布局，有屋52间，由门厅、中庭、庑廊、钟鼓楼和享堂组成，古朴浑厚，气势非凡。祠堂雕梁画栋，门窗栏杆等部件均雕刻精细，美不胜收。
据史料记载：蜀汉建兴3年，也就是公元225年，诸葛亮率3路大军平定南中叛乱。当时的僰道、即宜宾是诸葛亮南征的军需囤集补给地。东路军和中路军从宜宾挥师出发，诸葛亮亲率的西路军沿岷江而下，到宜宾后由水路上新市镇，七擒孟获于云南大理一带。同年12月，诸葛亮班师，到宜宾催科山安营扎寨，修整军队。
诸葛亮南征云南，兵至叙府受阻，便屯兵江左，日夜点兵。白天一队队骑兵威风凛凛，红马队，白马队，一遭遭轮番沿江而行；晚上，金鼓声声，火把阵阵，造成此起彼伏杀气腾腾之势。
为了纪念诸葛亮途径宜宾南征云南的壮举，宋朝时候就开始在现在流杯池公园东南修建了丞相祠。后来的岁月，屡经战乱破坏，又数度恢复修缮。1999年，再次规划重建。重建的丞相祠为明清时期川南民居风格的仿古祠堂，正殿塑诸葛亮、诸葛谨、诸葛尚一家三代忠烈像，侧廊为关羽、张飞、赵云、马超、黄忠五虎上将傲视其间，墙上彩绘壁画，讲述诸葛亮一生典型事例。